如果说在原世界中本能寺所发生了那一场惊天兵变导致一名将星的陨落，那么新世界中的这次本能寺之战，则直接导致了一个国家走向了覆灭。
了解到神道教在四国岛民众心中的位置与本能寺对此次战争起到的重要性后，孙林立即派出彰义队携带大量掷罐弓前往本能寺，之所以让彰义队队员带上掷罐弓，是因为他们此次任务并不单单是在日向家族的长子到达本能寺之前将其占领，他们同事还肩负着在日不落帝国援军到来之前，守住本能寺的任务，孙林可无法保证那些聚集在日向长子身边的尊幕派部队，不会做出在见到日不落军队占领本能寺之后走极端，而想要将本能寺烧毁来陷害日不落帝国的做法，而且如果此次争夺本能寺失败的话，孙林同样可以利用这些掷弹弓将尊幕派部队围困在本能寺，等待日不落援军到达后将其围歼，当然这是在逼不得已的情况下。
所谓的日不落援军，全部都来自于从之前攻占肥前、肥后与岗蒲3城的日不落路军。在彰义队出发之前，当日向家族族长（日向家族族长当时呆在岗蒲城，并没有呆在上野城）的首级悬挂在岗蒲城市上时，岗蒲城内的动乱就因为恐惧之心而被镇压下来，所以之前攻下岗蒲天守的1万日不落陆军才有能力派出军队追击逃跑的日向长子与其身边溃败的家臣、尊幕派部队，而他们派出的这支部队正是支援彰义队的3个日不落部队之一；至于其它两支，由于肥前、肥后两城的占有者小潘与三好两家族族长当时都在山野城，所以那两支支援部队估计要等待传令兵将两家族族长的首级送回去后才能出发。
同时，在孙林与毛利元就的商讨下，之前未参战的船只开始向四国岛移动，而孙林也暗中写了些信件交予鱼人海域侦查团团长，让其传递至后方，四国岛在孙林与毛利元就的布置下隐隐变成了一个口袋阵，等待着尊幕派往里跳…………….
而没过几天，孙林就从毛利家族隐藏在京都岛的忍者中得到己方想要的消息：此时由于尊幕派再次战败，之前被打压的连气都喘不过来的忠皇派立即跳出来进行反击，在政治上在言论上到处找尊幕派的茬，甚至连暗中派出忍者玩谋杀的的做法也不是没用过。
不过可惜的是，这些被报复之心与当局情形所迷惑的忠皇派家族没过多久，就再次背尊幕派的成员打压下去。玩政治玩言论的，没过多久就被尊幕派中掌握朝政，擅长暗中玩计谋的德川家族给整的切腹的切腹，入牢的入牢，至于那些玩暗杀的家族族长，没过多久就被擅长培养忍者、训练战场忍军的腹部家族给灭了。
而且这些忠皇派的家族始终忘记，他们这一派系的实力在四国岛争夺战中同样有损失，别忘了之前叛逃至尊幕派那边的家族在此次战场上同样被日不落一方给全歼了。
再次掌握政权的幕府将军终于从失子的痛苦中冷静下来，开始认真对待起日不落帝国，仅仅一天的时间里，这位西夷诸岛联合国的幕府将军利用忍者所建立的情报网，从四国岛那边了解到了日不落帝国虽然占领了4座天守，但并没有平定四国岛，包括神道教发源地的本能寺与其周边地区名义上还是属于西夷诸岛联合国的领土，而且在这座岛屿上，还有一支近万人的尊幕派部队拼死抵抗着日不落帝国的侵略的消息，虽然这位幕府将军并不知道，这个消息是孙林为了接下来的计划故意放出来的烟雾弹。
得知消息的幕府将军立即决定，利用手中的实权强征的忠皇派家族的所有战船来弥补此战尊幕派水军的损失，并散布日不落帝国折磨神道教僧人，打算火烧本能寺的消息，
信仰可以说是事件最为恐怖的武器，他们能让一群手无缚鸡之力平民立即化身变为士气达到报表境界的狂战士，当年十字军东征不正是由于信仰而引发的吗？在尊幕派与日不落间谍的合力散播下，因此谣言而组织起来希望前去保卫本能寺的民众越来越多。
于此同时，尊幕派的人也跳出来，以保卫本能寺的名义，不费一丝钱财粮食征召了近5万名杂兵，其中有刀法精湛的古武流大师，也有只会耍枪的农民，但不可否认的是，尊幕派之前损失的兵力在短短的时间里全部补充完毕，甚至还多出了1万人，而且尊幕派还顺带叫将造成如今这种情况的错误全部压到了忠皇派的身上，将忠皇派的家族打入了谷底。
随后，在5月上旬时，尊幕派已经重新将新的反攻海军整编完毕，共计3.5万人的足轻或西夷水手，与1.5万名武士部队乘坐上了那些挂着尊幕派家族旗帜，但之前是属于是忠皇派家族的战船，向着四国岛再次进发，但他们不知道京都岛这1周多时间里所发生的事情，全都在某位征服者的注视下，也正按照着那位征服者的计划所进行，当然他们跟不知道，早在5月1日那天，本能寺就已经被日不落一方在秋毫无犯的情况下占领了，之前传递四国岛消息的腹部忍者早已经被日不落帝国的间谍部队所替换了。
让我们将时间从回到5月1日那天清晨………………
此时石道两旁的青草上还沾满着清晨的露珠，但宁静的气氛却已经被奔跑的彰义队队员们所打破。在2天的时间里，这些昼夜赶路的武士们利用自己强大的意志，花费了60个小时左右，终于不负孙林的重望来到了本能寺中，当这群筋疲力尽的日不落西夷武士来到本能寺山脚下时，本能寺的钟声刚刚敲响3次，而其大门也在几位僧人们的推动下缓缓打开。见此情形，每位彰义队队员都知道自己成功的完成了任务——在日向长子的部队到来前进入本能寺。
“呼……….呼…………大家走吧，战斗才刚刚开始，等会儿进去不许乱动，还记得孙林冕下临行前盯住我们的话吗？”那位之前出现在皇家胜利号的武士，此时扶着身旁一位彰义队的队员，气喘吁吁的对着身后近千名彰义队队员问道。
“记得！让每位本能寺僧人，都成为我们日不落的士兵！”
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